西安交通大學口腔醫(yī)院成立于1985年，前身為西安醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院口腔科，具有50多年的淵源歷史。1975經(jīng)衛(wèi)生部批準建立口腔醫(yī)學系，1991年成立口腔醫(yī)學院。2000更名為西安交通大學口腔醫(yī)院。

西安交通大學口腔醫(yī)院是衛(wèi)生部直屬的集教學、醫(yī)療、科研、預(yù)防保健為一體的口腔專科醫(yī)院，是西北地區(qū)口腔醫(yī)學專業(yè)師資培訓中心，是衛(wèi)生部繼續(xù)醫(yī)學教育基地之一，是陜西省口腔醫(yī)療質(zhì)量控制中心、陜西省牙病防治指導(dǎo)組掛靠單位。醫(yī)院在職教職工270余人，其中教授，副教授46人，具有博士、碩士學位44人，博士生導(dǎo)師1人、碩士生導(dǎo)師20人。

口腔醫(yī)院具備陜西省三級甲等專科醫(yī)院的資質(zhì)，醫(yī)院設(shè)有牙科椅130把，病床76張，全院固定資產(chǎn)6000余萬元。設(shè)有臨床科室9個：牙體牙髓病科、牙周粘膜病科，兒童牙病科、口腔頜面外科、口腔修復(fù)科、口腔正畸科、口腔預(yù)防科、急特診科，種植中心；其中：口腔頜面外科為陜西省重點學科，口腔內(nèi)科（牙體牙髓病科、牙周粘膜病科，兒童牙病科）、口腔修復(fù)科為陜西省優(yōu)勢學科。醫(yī)輔科室5個：口腔影像科、藥劑科、病理科、檢驗科，技工中心。醫(yī)院除開展口腔常見病的治療外,在耳鼻器官再造、頜面整形美容、頭頸部腫瘤、顳頜關(guān)節(jié)紊亂癥、牙周病、口腔粘膜病、義齒修復(fù)、牙頜畸形矯治、種植義齒、小兒牙病等口腔疑難疾病的診斷、治療和技術(shù)、口腔疾病的預(yù)防保健等方面各具特色，居國內(nèi)先進水平，為患者提供優(yōu)質(zhì)的口腔疾病診治和保健服務(wù)。

醫(yī)院還設(shè)有口腔內(nèi)科、口腔頜面外科、口腔修復(fù)、口腔正畸和口腔預(yù)防5個教研室，招收碩士研究生。其中口腔頜面外科為國內(nèi)首批碩士點授權(quán)單位。共承擔口腔醫(yī)學專業(yè)本科18門課程教學，臨床醫(yī)學專業(yè)的《口腔科學》課程。承擔碩士生、本科生、進修生及繼續(xù)醫(yī)學教育等多層次的教學任務(wù)。近年來獲得省部級教學成果6項、校級教學成果3項、校級教改項目8項，出版專著5部、各類教材6部。口腔教學實驗中心具有先進的仿生頭模實驗室、口腔技工工藝實驗室、形態(tài)學實驗室和口腔頜面外科-影像實驗室，為研究生、本科生的實踐教學搭建了良好的平臺。

近年來醫(yī)院承擔國家自然科學基金、“863”、省部級、市廳級科研項目60余項。投資500多萬元設(shè)立口腔醫(yī)學研究中心，從事口腔基礎(chǔ)醫(yī)學研究和口腔臨床醫(yī)學應(yīng)用研究的工作，中心建立了設(shè)施完備的口腔“細胞與分子生物學”研究平臺。該中心可從事動物實驗、細胞培養(yǎng)、蛋白質(zhì)和核酸大分子等方面的研究。

醫(yī)院注重與國內(nèi)外高校、科研單位和醫(yī)療機構(gòu)的學術(shù)交流與合作，近年來先后與美國、日本、挪威等多個國家和香港地區(qū)的學術(shù)團體及醫(yī)療機構(gòu)建立了合作關(guān)系。