浙江大學醫學院附屬兒童醫院（浙江省兒童醫院、浙江省兒童保健院）最早可追溯至1912年成立的“浙江醫學專門學校”附屬醫院，其前身是1951年5月成立的“浙江省立婦幼保健院”，創始人和首任院長為我國著名兒科專家厲矞華教授。自1954年單獨建制以后，醫院先后更名為“浙江醫科大學附屬兒童保健院”、“浙江醫科大學附屬兒童醫院”，同時使用“浙江省兒童保健院”名稱。1998年，原浙江大學、杭州大學、浙江農業大學、浙江醫科大學四所學校合并成立了國內規模最大的綜合性大學即現“浙江大學”，醫院正式命名為“浙江大學醫學院附屬兒童醫院”、“浙江省兒童醫院”、“浙江省兒童保健院”。醫院目前是浙江省最大的三級甲等綜合性兒童醫院和兒科學國家重點專科單位，承擔著全省兒科醫療、教學、科研、兒童保健及突發性公共衛生事件應急任務。醫院現設有濱江和湖濱兩個院區，其中濱江院區作為主院區位于錢塘江南岸，總建筑面積130500平方米，其中一期工程設有門診、急診、實驗檢驗中心、住院部、感染樓、行政后勤七大功能區塊；湖濱院區位于西子湖畔，建筑面積40511平方米，設有門診、急診、醫技、住院部、行政后勤等區塊，醫院核定床位1900張，年門急診病人約240萬人次，年住院病人5萬余人次，年開展手術2萬余臺。
　　經過六十余年的精心建設，醫院學科水平、臨床業務能力及綜合實力均處于全國兒童醫院前列，現兒科學為國家重點學科，兒科重癥專業、新生兒專業、小兒消化專業、小兒呼吸專業為國家臨床重點專科，兒科重癥專業、新生兒專業、小兒消化專業、小兒呼吸專業為國家臨床重點專科，新生兒專業、心胸外科專業、血液腫瘤專業、兒童保健專業、小兒圍手術期醫學、青春期醫學、兒童腎臟病學、小兒心血管病學、小兒麻醉學、兒科學（血液和腫瘤）為省醫學重點學科，并擁有浙江大學生殖遺傳教育部重點實驗室、浙江省新生兒疾病防治重點實驗室、浙江省兒童出生缺陷早期篩查與干預技術重點創新團隊、浙江省新生兒與圍產醫學重點學科群。醫院是浙江省新生兒疾病防治中心、浙江省小兒心血管疾病防治中心、浙江省新生兒疾病篩查中心、浙江省新生兒疾病篩查質控中心、浙江省兒童生長發育質控中心、浙江省基因診斷中心、浙江省聽力篩查管理中心所在地，兒科學碩士學位授予點、博士學位授予點和博士后流動站。醫院還被國家食品藥品監督管理局認定為藥物臨床試驗機構，包括小兒消化、小兒呼吸、小兒心臟病、小兒腎病、小兒血液病、小兒神經病學、小兒內分泌、兒童保健、小兒重癥醫學、小兒麻醉10個專業的藥物臨床試驗資格獲得認定。
　　秉承“病人至上，質量為本，科教興院，服務第一”的宗旨，醫院力求打造總體規模國內領先、并具有國際先進水平的現代化兒童醫療、科研、教學、保健中心，為保障兒童健康、推動兒科學發展做出更大的貢獻。
　　醫院兒科學三級專業設置齊全，其中兒內科設心血管內科、消化內科、神經內科、內分泌科、呼吸內科、血液科、腎臟內科、腎臟泌尿中心、風濕免疫科、綜合內科、綜合ICU、康復科、感染病科、臨床營養科；兒外科設SICU、心臟外科、胸外科、腫瘤外科、普外科、新生兒外科、外科腔鏡中心、神經外科、燒傷整形外科、骨科、泌尿外科、急診創傷外科；新生兒科設新生兒內科、NICU；兒童保健部設兒童保健科、遺傳代謝病科、發育行為兒科、心理科、小兒婦科。另外醫院還設有急診科-PICU、耳鼻咽喉科、眼科、口腔科、皮膚科、麻醉科、中醫科。
　　新生兒專業現為國家臨床重點專科、浙江省醫學重點學科和中華醫學會兒科分會新生兒學組組長單位，其新生兒監護中心（NICU）是改革開放后美國HOPE基金會在華的首個建設項目，是國內最早、最規范的新生兒重癥監護中心之一，在國內最早開展肺表面活性物質應用、一氧化氮吸入治療和體外膜肺氧合（ECMO）技術，對各種危重癥新生兒疾病及新生兒先天缺陷的術后監護具有較高水平，極低體重兒存活率90％以上，最低存活者體重僅562g，在新生兒呼吸衰竭、持續肺動脈高壓、極低體重兒管理、早產兒腦損傷的臨床及基礎研究等方面均處國內領先水平，是國內新生兒重癥監護的重要培訓基地。
　　小兒消化專業為國家臨床重點專科和中華醫學會兒科分會消化學組組長單位，集專科門診、病房、消化內窺鏡室、胃腸動力室和消化病實驗室為一體，在全國率先開展兒童胃腸鏡診斷和治療技術、消化道動力檢查和治療，并開展鼻空腸管置入、小兒經皮肝穿刺技術、膠囊內鏡等技術，小兒消化系統疾病的診治技術國內領先，對小兒胃腸病有一系列成熟的診斷和治療方案。
　　心血管中心包括心血管內科和心胸外科。其中，心血管內科為中華醫學會兒科分會心血管學組成員及浙江省醫學會兒科分會心血管學組組長單位，浙江省兒童心血管疾病防治中心，開展各種小兒心臟病的內科診治及小兒先天性心臟病心導管診斷和治療，年介入治療先心患兒470余例，累計完成介入治療手術3000余例。心胸外科為浙江省醫學重點學科和中華醫學會小兒外科分會心胸外科學組副組長單位，全面開展各類先天性心臟病手術和復雜心臟畸形的分期姑息或根治手術，年開展手術1400余例，其中體外手術800余例，手術總成功率達98.5％，其中體外循環心臟手術最低體重患兒僅1700克，復雜先心術后ECMO技術的應用刷新了亞洲最低體重紀錄。
　　血液腫瘤專業為浙江省醫學重點學科，是國內最早成立的診治兒童血液系統惡性疾病的專業，采用聯合化療為主的綜合治療方法，輔以免疫治療以及造血干細胞移植治療白血病、惡性淋巴瘤等常見血液惡性疾病，并開展多種高新技術對白血病微小殘留病進行實時監測。小兒急性淋巴細胞白血病5年無病生存率為82.3％,急性髓細胞系白血病5年無病生存率達56％，兒童輕、重型再障有效率達80％。自行研制抗白血病單克隆抗體40個，其中20個單抗正式納入國際CD命名系統，開展血液腫瘤的抗體分子靶向治療研究。
　　兒童保健專業為浙江省醫學重點學科和中華預防醫學會兒童保健分會侯任主任委員、中華兒童保健學會新生兒疾病篩查學組組長、中華醫學會兒科分會兒童保健學組副組長單位，下設兒童保健科、遺傳代謝病科、心理科、康復科、發育行為兒科、少兒婦科。專業致力于保障和促進兒童體格、運動、語言認知和社會情緒的全面發展，跟蹤國際前沿的研究進展并應用于臨床實踐，并配合衛生行政部門對全省兒童保健工作進行指導，開展多項大規模的兒童保健流行病學調查和國際合作科研項目，為衛生決策提供資料。
　　兒科重癥專業為國家臨床重點專科，設有急診科、內科監護中心（PICU）和外科監護中心（SICU），設監護床位50張。危重癥搶救成功率超過98%，對兒內外科危重病有較高的診治水平，在國內較早開展ECMO、小兒血液灌流、血液免疫吸附、血漿置換、連續腎臟替代治療、人工肝、骨髓腔輸液、小兒纖維支氣管鏡肺灌洗、PICCO儀兒童血流動力學持續監測、無創機械輔助通氣、兒童小腸喂養技術、自體血回輸等技術。
　　小兒呼吸專業為國家臨床重點專科、中華醫學會兒科分會呼吸學組小兒纖維支氣管鏡研究協作組副組長單位，對呼吸科各種疾病及呼吸道疑難雜癥的病因診斷和治療具有豐富的臨床經驗，每年開展小兒支氣管鏡檢查與治療1200余例，并開展過敏原檢測、免疫功能測定、肺功能測定、特異性免疫治療、霧化吸入等診斷治療手段。
　　近五年，醫院共獲得科研經費7600余萬元，各類科研課題400余項，其中負責國家科技支撐計劃課題3項，衛計委重大專項項目1項，973項目子課題3項，國家自然科學基金項目64項。在科研成果方面，醫院近五年獲得“宋慶齡兒科醫學獎”3項，浙江省科技進步一等獎4項，發表SCI收錄論文380余篇。根據中國信息研究所統計數據顯示，2013年醫院被SCI、MEDLINE收錄論文（包括Article、Review、Letter、EditorialMaterial）排名全國兒童醫院第二位；2000至2013年醫院SCI收錄論文累計被引用篇數和被引用次數繼續排名全國兒童醫院第一位。2008年，醫院創辦的全英文兒科學國際期刊WorldJournalofPediatrics在發刊7期后即被SCI-Expanded和MEDLINE/PubMed等國際權威數據庫收錄。根據美國科學信息研究所期刊引證報告，WorldJournalofPediatrics2014年IF為1.236，繼續穩居亞洲同類期刊第一，在全球兒科學領域同類期刊中排名75位，并成功入選中國科技期刊國際影響力提升計劃（全國共8本期刊入選），并獲得CN號。
　　作為浙江大學教學醫院，醫院按照浙江大學建設創新型大學的要求，醫院全面推動專業、課程、基地建設與教學方法的改革和創新，將理論知識與臨床實踐有效結合，促進教學質量和學生綜合素質的提高，并建立了一整套成熟、完善的教學體系和一支高水平、經驗豐富的師資隊伍。十余年來，醫院兒科學先后被評為浙江大學醫學院精品課程、浙江大學校級精品課程、浙江大學教學示范課程、浙江省精品課程，共獲得各類教學榮譽近80次，先后主編教材7部。在完成兒科教學工作的同時，醫院作為衛生部專科醫師培訓基地、國家級和省級繼續教育基地、衛生部臨床藥師培訓基地、浙江省小兒ICU專科護士培訓基地，在研究生教育、兒科醫護人員培訓、進修等兒科人才培養方面發揮了重要作用。
　　在人才重點培養、儲備、引進以及人才梯隊的建設方面，醫院逐步培養了一支兼具醫、教、研綜合能力和創新意識的拔尖人才隊伍。醫院現總人數2384人，其中：醫生666人，護士976人，醫技人員168人；（藥劑：107人）正高級職稱人員87人，副高級職稱人員146人；博士學位人員93人，碩士學位人員571人；博士生導師15人，碩士生導師38人。近50人次在全國性或國際學術機構擔任重要職務，包括中華醫學會兒科分會候任主任委員、中華預防醫學會兒童保健分會侯任主任委員、中國醫師協會兒科分會副主任委員、中國婦幼保健協會常務理事、中華預防醫學會兒童保健分會新生兒篩查學組組長、中華醫學會兒科分會新生兒學組組長、中華醫學會兒科分會消化學組組長、中華醫學會兒科分會兒童保健學組副組長、中華醫學會兒科分會小兒血液學組副組長、中華醫學會小兒外科分會心胸學組副組長、中華醫學會病理學分會兒科病理學組副組長、中華兒科雜志副主編、《兒科學》八年制教材副主編、BMCPediatrics副主編、亞太內分泌學會秘書長等職務。
　　立足浙江大學平臺，醫院堅持“走出去、請進來”，國際交流與合作的步伐逐漸加快。特別是近幾年來，浙大兒院的外事活動進入常態化，每年有100位左右的國際一流大學、研究機構、兒童醫院負責人、專家、學者來院開展訪問、講學、會診、手術等多種形式的交流，醫院則通過院內、學校、海外的外事項目和科研合作等多種渠道每年選派20名左右的骨干前往國外大學和兒童醫院進修、培訓。現醫院與美國羅馬琳達大學兒童醫院、西雅圖兒童醫院、辛辛那提兒童醫院建立了實質性的院際合作關系。
　　醫院始終堅持“病人至上，質量為本，科教興院，服務第一”的辦院宗旨，注重內涵建設和公益性，不斷強化服務意識，提升服務品質，贏得了社會各界的普遍信任和高度贊譽。醫院獲得“全國婦幼衛生先進集體”、“全國衛生應急先進單位”、“全國醫院（衛生）文化建設先進單位”、“全國工人先鋒號”、“浙江省文明醫院”、“浙江省衛生系統先進集體”、“浙江省疾控先進單位”、“浙江省衛生應急工作先進集體”、等各類榮譽稱號70余項。醫院還與國內外慈善組織合作開展十余個慈善醫療救助項目，近年來共募集各類醫療善款3000余萬元，救助貧困患兒1600余名，取得了顯著的社會效益。